BESPOKE ANALYSIS WORKFLOW DEVELOPMENT

Automatisation, gestion de Bigdata, développement d'interfaces graphiques

Les experts de TRI-Genotoul développent à la demande des workflows dédiés au traitement, à la segmentation et à l’analyse automatisée et reproductible de grands volumes de données.
Ces développements couvrent l’ensemble du processus, de la conception de la solution en lien avec les problématiques et besoins jusqu’à sa mise en application sur les données utilisateurs.

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Services

  • Développement de workflow pour l'analyse de données multi-echelles de microscopie photonique
  • Développement de workflow pour l'analyse de données de microscopie électronique
  • Développement de pipeline pour l'analyse non supervisée de données de cytométrie en flux
  • Développement d'interfaces pour la visualisation et la manipulation de données

Access method

  • With assistance
  • As service delivery
  • Formation
  • Collaboration

Les Ressources logicielles

Logiciel

Version & options

Plateau(x)

IDEAS

Data exploration and analysis from Image cytometry

Infinity, Restore

FlowJo

Advanced data analysis for flow cytometry

Infinity, IPBS, Restore

Harmony

Visualize and analyze 2d/3d images from High-Content Imaging

Restore

Imaris

AI Microscopy Image analysis avec Full package and Imaris batch // Imaris for Neuroscientists // ​Imaris for Cell Biologist + FilamentTracer

Infinity

Matlab

Engineering applications for data analysis, signal and image processing and data computing

Restore

Metamorph

Data Analysis from microscopy imaging

IPBS

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