DATA RECONSTRUCTION AND MODELLING

En profondeur (3d) ou résolu dans le temps, sur échantillon vivant ou fixé

TRI-Genotoul propose un ensemble de ressources et de services dédiés à la transformation de données d’imagerie complexes en informations exploitables. À partir de données brutes, souvent constituées de séries d’images 2D acquises sous différents angles ou à différentes profondeurs, les plateaux mettent en œuvre des approches de reconstruction permettant d’obtenir des représentations tridimensionnelles ou résolues dans le temps. En complément, des outils de modélisation permettent de générer des représentations 2D et 3D des données reconstruites. Ces visualisations facilitent à la fois le contrôle qualité, l’exploration des jeux de données et leur interprétation scientifique.
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Services

  • Reconstruction d'images 3D en profondeur
  • Reconstruction d'images 2D ou 3D résolues dans le temps
  • Visualisation de données multiparamétriques de cytométrie en flux et en image
  • Recalage et fusion d'images acquises à différents angles - Microscopie en feuille de lumière
  • Reconstruction de mosaïques d'images pour l'acqusition de grands échantillons
  • Recalage d'images multimodales ou multicanaux
  • Modélisation 2D, 3D ou résolue dans le temps de données d'imagerie photonique ou electronique

Access method

  • With assistance
  • As service delivery
  • Formation
  • Collaboration

Les Ressources logicielles

Logiciel

Version & options

Plateau(x)

AIVIA

Artificial intelligence – guided image analysis and visualization solutions & Cell Biology pack

FR3450

Amira

Advanced biological image analysis – Cell Biology pack

CMEAB, Restore

ARIVIS Vision4d

Advanced data analysis for microscopy imaging

CBI, Restore

Flowjo

Advanced data analysis for flow cytometry

Infinity, IPBS, Restore

Harmony

Visualize and analyze 2d/3d images from High-Content Imaging

Restore

HCImage

Data Analysis from High content imaging

IPBS

IDEAS

Data exploration and analysis from Image cytometry

Infinity, Restore

Imaris

AI Microscopy Image analysis avec Full package and Imaris batch // Imaris for Neuroscientists // ​Imaris for Cell Biologist + FilamentTracer

CBI, Infinity, IPBS, Restore

Infinicyt

Analysis, integration and interpretation of multivariate flow cytometry data

I2MC

Metamorph

Data Analysis from microscopy imaging

IPBS

NDPview2+

Image viewing software for large microscopic dataset

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