Pollen de fleur – CMEAB
Cette formation répartie sur 3 périodes de stage (12-13,17-18, 24-25 septembre) vise à présenter les différentes techniques de préparations et d’observation des échantillons biologiques en microscopie électronique à balayage avec leurs avantages et inconvénients. Formation limitée à 8 participants maximum
Objectifs |
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Programme |
Théorique
Travaux pratiques
Intervenants Bruno Payré, Céline Guilbeau-Frugier, Isabelle Fourquaux, Dominique Goudounèche |
Inscriptions administrative avant le 29 juin 2018 :
Mission Formation Continue et Apprentissage
- Sophie Cobourg ( sophie.cobourg@univ-tlse3.fr / Tél : +33 5 61 55 87 12)
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Objectifs
- Acquérir des bases théoriques et pratiques sur la microscopie de fluorescence
- Connaître les avantages et les limites des divers systèmes d’acquisition d’image en microscopie
- S’initier aux nouveaux développements en microscopie de fluorescence
Public
Chercheurs, ingénieurs, techniciens désireux de s’initier aux techniques d’imagerie en fluorescence
Pré-requis
Aucun, si ce n’est un intérêt clairement affiché pour l’imagerie optique du vivant
Programme
Cours théoriques (14 h) :
Le cours insistera sur les notions de base requises pour acquérir des images dans les meilleures conditions possibles, en fonction de chacune des méthodes utilisées, sur la diversité des échantillons susceptibles d’être imagés, sur les précautions à prendre pour éviter les erreurs d’interprétation. – Le microscope en fond clair et à fluorescence, principe, description, réglages importants, acquisition d’images sur système champ large, les caméras CCD et C-MOS
- Les sondes et les protéines fluorescentes
- Analyse de l’interaction des protéines par FRET (Fluorescence Resonance Energy Transfer)
- La microscopie confocale mono et multiphotonique : principes et applications
- La déconvolution des images
- Imagerie 3D en microscopie à feuille de lumière
- Les techniques de super-résolution
- La préparation des échantillons
- L’imagerie intra-vitale et l’imagerie du petit animal
Travaux pratiques (18 h, en sous-groupe de 4 stagiaires max.) :
Travaux pratiques en petits groupes sur différents appareillages de la plateforme d’imagerie toulousaine (microscopes champ large, confocaux, multiphotons, SPIM…)
- Avantages et limites des différents systèmes
- Acquisition et analyse des images dans les meilleures conditions
Note : Possibilité de faire les TP, à des fins pédagogiques, sur des échantillons apportés par les stagiaires
Equipements (plateformes CPTP & IPBS)
Microscopes champ large, microscopes confocaux, microscope multiphotons, caméras CCD, microscope et macroscope à feuille de lumière (SPIM), microscope intravital, système d’acquisition de fluorescence corps entier
Intervenants
Chercheurs et ingénieurs des instituts de recherche suivants :
- Fédération de recherche en biologie de Toulouse (FR 3451)
- Fédération de recherche agrobiosciences, interactions et biodiversité (FR 3450)
- Institut des technologies avancées en sciences du vivant (ITAV – Centre Pierre Potier)
- Fédération de recherche biomédicale de Toulouse (SFR BMT)
Une formation proposée avec :
Quelques commentaires des stagiaires :
“Cette formation va me permettre d’optimiser mes manips et mes acquisitions d’images en champ large. J’espère par le futur pouvoir mettre à profit les compétences nouvellement acquises en confocal et pourquoi pas en FRET.”
Aurore F., agence nationale”
“Très bien, bon contenu et bonne organisation.“
Olivier T., industrie pharmaceutique
“Très bonne formation, avec des intervenants passionnés et passionnants.“,
Laurent C., établissement de recherche
Objectifs
- Assimiler les bases théoriques de la microscopie multiphotonique
- Connaître les atouts et les faiblesses de l’endomicroscopie
- Savoir utiliser les outils nécessaires à l’élaboration d’expérimentations dans le domaine de l’imagerie multiphotonique intravitale et sur explant tissulaire : préparation d’échantillons vivants, acquisition et visualisation des images
- Savoir acquérir des images in vivo sur un animal entier ou sur explant tissulaire
Public
Chercheurs, ingénieurs, techniciens
Pré-requis
Avoir de solides bases en microscopie de fluorescence. Avoir par exemple suivi un des stages “La microscopie de fluorescence : bases et nouveautés” (Réf. 18126, catalogue CNRS) ou “Atelier de microscopie confocale” (Réf. 18129, catalogue CNRS) ou niveau équivalent.
Programme
Cours théoriques (40%) :
- Bases théoriques de la microscopie biphotonique
- Endoscopie linéaire
- Sondes pour la microscopie biphotonique
- Microscopie biphotonique ex-vivo : élaboration d’expériences sur tissu explanté
- Microscopie biphotonique intravitale : élaboration d’expériences sur animal anesthésié
Travaux pratiques (60%) :
TP en sous-groupes de 4 stagiaires avec un intervenant par sous-groupe.
- Coupe de tissu frais, explantation, puis imagerie multicouleur SHG en biphoton
- Imagerie intravitale chez la souris en biphoton
- Endoscopie linéaire : imagerie intravitale chez la souris
- Visualisation et analyse des images acquises avec le logiciel Imaris (Bitplane)
- Table ronde et retour d’expérience : échanges sur les problématiques des stagiaires
Note : Possibilité de faire les TP, à des fins pédagogiques, sur des échantillons apportés par les stagiaires
Equipements (plateformes CPTP & IPBS)
2 microscopes Zeiss 7 MP ; endoscope MonaKea Technologie
Intervenants
- S. Allart, E. Bellard, M. Rodrigues (ingénieures) et S. Boullier (maître de conférences)
Une formation proposée avec :
Quelques commentaires des stagiaires :
“Les différents setups et astuces seront très utiles ! “
Thibault N., établissement de recherche
“Accueil très agréable.”
Céline M.établissement de recherche