Cette formation intensive est destiné au personnel académique ou entreprise désireux d’améliorer les connaissances et compétences concernant l’acquisition et l’interprétation des images et données résultant des techniques de microscopies ou de cytométries. Événement intensif se déroulant sur 4 jours et demi, il mêlera cours théoriques (50% – limité à 10 stagiaires) et travaux pratiques (50% par sous-groupes de 4 personnes maximum), il sera maillé d’exercices visant à accompagner les stagiaires dans leur progression.
Salariée, TRANSGENE SA
OBJECTIFS
- Acquérir des bases théoriques en microscopie photonique et électronique, en cytométrie et analyse des données
- Connaître les applications possibles pour chaque technologie
- Comprendre l’aspect pratique de ces méthodes
PUBLIC & MODALITÉS
- Public : Chercheurs, ingénieurs, techniciens désireux de s’initier aux techniques d’imagerie en fluorescence
- Effectifs : 10 stagiaires maximum, TP en sous-groupes de 4 stagiaires maximum avec 1 intervenant par sous-groupe
- Évaluation : Tout au long de la formation, des exercices corrigés permettront au stagiaire d’évaluer son acquisition des connaissances. Les acquis des stagiaires seront évalués à l’issue de la formation et attestation de formation sera délivrée.
- Équipement des stagiaires : il est conseillé de se munir de son propre ordinateur portable.
PROGRAMME
Le cours insistera sur les connaissances de base requises pour comprendre les différentes techniques et les applications possibles. Des travaux pratiques présenteront les avantages et limites des différents systèmes.
- La cytométrie : principes, composants d’un cytomètre, la fluorescence et la cytométrie en image
- Applications en cytométrie : cycle cellulaire, apoptose, phénotypage, interaction cellulaire, cytométrie en image, dosage de cytokines, sondes métaboliques, tri cellulaire
- La microscopie : les différents types de microscopie photonique (fond clair, contraste de phase, fluorescence?)
- La microscopie de fluorescence : marquage, biosenseurs et applications
- L’échantillon sous le microscope : interaction lumière / échantillon et préparation d’échantillon
- Les différents types de microscopes de fluorescence : performances, avantages et inconvénients
- Présentation des méthodes pour la préparation d’échantillons en microscopie électronique en transmission (MET)
- Comprendre les principes de base des microscopes électroniques en transmission
- Principes des microscopes électroniques à balayage (MEB)
- Préparation des échantillons en MEB
- Généralités sur l’analyse de données
- Application à l’analyse d’images
Travaux pratiques (60 %) – Réalisés en petits groupes sur différents appareillages de la plateforme d’imagerie toulousaine (microscopes champ large, confocal, multiphoton, SPIM…)
- Avantages et limites des différents systèmes
- Acquisition et analyse des images dans les meilleures conditions
Possibilité de faire les TP, à des fins pédagogiques, sur des échantillons apportés par les stagiaires
ÉQUIPEMENTS & INTERVENANTS
- Microscopes champ large, confocaux, multiphotons, à feuille de lumière, cytomètres analyseurs, trieurs, cytomètres en image, microscopes électroniques à transmission, microscopes électroniques à balayage. Les équipements employés figurent sur le site (TRI).
- Ingénieurs des instituts de recherche suivants : Fédération de recherche Agrobiosciences, interactions et biodiversité ; Fédération de recherche biologie et biotechnologie pour la santé
Contact et inscription
- Pour plus d’informations, contact : Jacques Rouquette
- Inscriptions sur le site du CNRS
Formation labellisée QUALIOPI et AFAS ISO9001