PHENOTYPAGE MOYEN DEBIT

	Le compromis entre simplicité de mise en œuvre et caractérisation poussée
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Le phénotypage moyen débit offre un compromis entre criblage par imagerie haut débit et simplicité de traitement d’un important volume d’échantillons. D’une part la caractérisation est suffisamment poussée pour analyser de nombreux indicateurs (comptage, mesure de taille, d’intesite de fluorescence, rendu surfacique, analyse colorimétrique…) et d’autre part le volume d’échantillons traités permet de lisser l’information par une analyse statistique ou au contraire de mettre en exergue un évènement particulier. Mis en place au sein du plateau d’imagerie dédié au végétal, il est principalement dédié à l’étude du végétal cependant des ressources telles que l’axiozoom peuvent être adaptées à l’étude du tissu animal.

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Nos domaines d’expertise

• Screening et phénotypage (étude phytopathogènes ou agents symbiotiques, études de molécules impactant le développement des plantes et/ou leur résistance, étude nécroses…)
• Analyse topographiques et d’épaisseur (mycéliums…),
• Classification rapide des plantules
• Semi-automatisation des analyses (macros sous Image J)

 

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Nos ressources spécialement dédiées au phénotypage moyen débit

Le végétal requiert une expertise particulière. Les matériels présentés ci-dessous sont associés à des compétences développées au sein du plateau d’imagerie permettant de prendre en charge tout ou partie de la prestation ou collaboration.

 

Axiozoom à platine motorisée Acquisitions en fluorescence et en lumière blanche, en z et en fonction du temps. La platine motorisée permet d’imager de larges zones et de suivre dans le temps différentes zones de l’échantillon. Un module dédié permet également d’imager des boites multi-puits.	Microscope Keyence Dédié aux observations en 3D de surface ce microscope permet de topographier et de faire des mesures d’épaisseur des échantillons. Il permet aussi de scanner à haute résolution des éléments très fins et très peu contrastés tel que des hyphes de champignons filamenteux en gélose.
Objectscan 1600 La profondeur du tiroir permet de scanner des objets hauts de 8cm tel que des plants avec une grande profondeur de champ. Le scan et l’éclairage se font par le dessus avec un éclairage homogène permettant l’analyse colorimétrique. En bref : Grande profondeur de champ, 1600dpi, éclairage par le dessus	Scanner 9600XL Scanner à plat de type bureautique, format A3 couleur. Scan par le dessous et éclairage par les deux faces. Bonne résolution, éclairage homogène pour analyse colorimétrique. Scan de négatifs et de diapositives pour l’archivage d’anciennes données. En bref : A3 couleur, 600dpi, scan par le dessous et éclairage biface homogène

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Équipements acquis avec le soutien de :