CALENDRIER

Pollen de fleur – CMEAB

Cette formation répartie sur 3 périodes de stage (12-13,17-18, 24-25 septembre) vise à présenter les différentes techniques de préparations et d’observation des échantillons biologiques en microscopie électronique à balayage avec leurs avantages et inconvénients. Formation limitée à 8 participants maximum

Inscriptions administrative avant le 29 juin 2018 :

Mission Formation Continue et Apprentissage

• Sophie Cobourg  ( sophie.cobourg@univ-tlse3.fr / Tél : +33 5 61 55 87 12)
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Confocal microscope – E. D’aldebert, CPTP

Cette formation répartie sur 2 périodes de stage (27&28 septembre et 8&9 novembre) vise à faire découvrir les possibilités offertes par le logiciel Image-J ainsi qu’à transmettre les bases du traitement et de l’analyse des images numériques en biologie.

Formation ouverte aux personnels non Inserm dans la limite des places disponibles.

• Pour le personnel Inserm : Site SIRENE
  
• Pour les extérieurs : Joëlle COUHET ( joelle.couhet@inserm.fr/ Tél : +33 562 748 301)
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 Objectifs

• Acquérir des bases théoriques et pratiques sur la microscopie de fluorescence
• Connaître les avantages et les limites des divers systèmes d’acquisition d’image en microscopie
• S’initier aux nouveaux développements en microscopie de fluorescence

Public

Chercheurs, ingénieurs, techniciens désireux de s’initier aux techniques d’imagerie en fluorescence

Pré-requis

Aucun, si ce n’est un intérêt clairement affiché pour l’imagerie optique du vivant

Programme

Cours théoriques (14 h) :

Le cours insistera sur les notions de base requises pour acquérir des images dans les meilleures conditions possibles, en fonction de chacune des méthodes utilisées, sur la diversité des échantillons susceptibles d’être imagés, sur les précautions à prendre pour éviter les erreurs d’interprétation. – Le microscope en fond clair et à fluorescence, principe, description, réglages importants, acquisition d’images sur système champ large, les caméras CCD et C-MOS

• Les sondes et les protéines fluorescentes
• Analyse de l’interaction des protéines par FRET (Fluorescence Resonance Energy Transfer)
• La microscopie confocale mono et multiphotonique : principes et applications
• La déconvolution des images
• Imagerie 3D en microscopie à feuille de lumière
• Les techniques de super-résolution
• La préparation des échantillons
• L’imagerie intra-vitale et l’imagerie du petit animal

Travaux pratiques (18 h, en sous-groupe de 4 stagiaires max.) :

Travaux pratiques en petits groupes sur différents appareillages de la plateforme d’imagerie toulousaine (microscopes champ large, confocaux, multiphotons, SPIM…)

• Avantages et limites des différents systèmes
• Acquisition et analyse des images dans les meilleures conditions

Note : Possibilité de faire les TP, à des fins pédagogiques, sur des échantillons apportés par les stagiaires

Equipements (plateformes CPTP & IPBS)

Microscopes champ large, microscopes confocaux, microscope multiphotons, caméras CCD, microscope et macroscope à feuille de lumière (SPIM), microscope intravital, système d’acquisition de fluorescence corps entier

Intervenants

Chercheurs et ingénieurs des instituts de recherche suivants :

• Fédération de recherche en biologie de Toulouse (FR 3451)
• Fédération de recherche agrobiosciences, interactions et biodiversité (FR 3450)
• Institut des technologies avancées en sciences du vivant (ITAV – Centre Pierre Potier)
• Fédération de recherche biomédicale de Toulouse (SFR BMT)

• Télécharger le programme de la formation
• Inscription en ligne sur le site de CNRS formation
• Télécharger le bulletin d’inscription

Une formation proposée avec :

Quelques commentaires des stagiaires :

“Cette formation va me permettre d’optimiser mes manips et mes acquisitions d’images en champ large. J’espère par le futur pouvoir mettre à profit les compétences nouvellement acquises en confocal et pourquoi pas en FRET.”

Aurore F., agence nationale”

“Très bien, bon contenu et bonne organisation.“

Olivier T., industrie pharmaceutique

“Très bonne formation, avec des intervenants passionnés et passionnants.“,

Laurent C., établissement de recherche

 Objectifs

• Assimiler les bases théoriques de la microscopie multiphotonique
• Connaître les atouts et les faiblesses de l’endomicroscopie
• Savoir utiliser les outils nécessaires à l’élaboration d’expérimentations dans le domaine de l’imagerie multiphotonique intravitale et sur explant tissulaire : préparation d’échantillons vivants, acquisition et visualisation des images
• Savoir acquérir des images in vivo sur un animal entier ou sur explant tissulaire

Public

Chercheurs, ingénieurs, techniciens

Pré-requis

Avoir de solides bases en microscopie de fluorescence. Avoir par exemple suivi un des stages “La microscopie de fluorescence : bases et nouveautés” (Réf. 18126, catalogue CNRS) ou “Atelier de microscopie confocale” (Réf. 18129, catalogue CNRS) ou niveau équivalent.

Programme

Cours théoriques (40%) :

• Bases théoriques de la microscopie biphotonique
• Endoscopie linéaire
• Sondes pour la microscopie biphotonique
• Microscopie biphotonique ex-vivo : élaboration d’expériences sur tissu explanté
• Microscopie biphotonique intravitale : élaboration d’expériences sur animal anesthésié

Travaux pratiques (60%) :

TP en sous-groupes de 4 stagiaires avec un intervenant par sous-groupe.

• Coupe de tissu frais, explantation, puis imagerie multicouleur SHG en biphoton
• Imagerie intravitale chez la souris en biphoton
• Endoscopie linéaire : imagerie intravitale chez la souris
• Visualisation et analyse des images acquises avec le logiciel Imaris (Bitplane)
• Table ronde et retour d’expérience : échanges sur les problématiques des stagiaires

Note : Possibilité de faire les TP, à des fins pédagogiques, sur des échantillons apportés par les stagiaires

Equipements (plateformes CPTP & IPBS)

2 microscopes Zeiss 7 MP ; endoscope MonaKea Technologie

Intervenants

• S. Allart, E. Bellard, M. Rodrigues (ingénieures) et S. Boullier (maître de conférences)

• Télécharger le programme de la formation (pdf)
• Inscription en ligne sur le site de CNRS formation
• Télécharger le bulletin d’inscription

Une formation proposée avec :

Quelques commentaires des stagiaires :

“Les différents setups et astuces seront très utiles ! “

Thibault N., établissement de recherche

“Accueil très agréable.”

Céline M.établissement de recherche

 Objectifs

• Acquérir des connaissances de base en biologie cellulaire, une pratique simple de la préparation des échantillons biologiques pour les observations en microscopie photonique de fluorescence et gagner en autonomie par rapport à leur pratique de préparation des lames
• Expérimenter et maitriser des protocoles simples de préparation d’échantillons pour la microscopie afin de tester leurs microscopes expérimentaux, avant de se lancer dans des collaborations pluridisciplinaires plus poussées,
• Mieux appréhender la qualité des échantillons de leurs utilisateurs de plateforme d’imagerie,
• Mieux comprendre les marquages, leurs enjeux et répercussions sur un travail d’analyse d’image.

Public

Chercheurs, Ingénieurs, techniciens non-biologistes travaillant en plateformes ou en laboratoires, et étant en contact avec des échantillons biologiques

Intervenants

• S. Allart, M. Rodriguez, Delphine Muriaux, Sandrine Lecart et Marie-Noelle Soler

• Télécharger le programme de la formation (pdf)
• Inscription auprès de Hélène Feuillerat (05 61 33 60 05 / helene.feuillerat@dr14.cnrs.fr) avant le 14 septembre.